Бактерии, живущие внутри злокачественных клеток, могут помочь эффективно лечить онкологию
Исследование, проведённое сотрудниками Институте Вейцмана и опубликованное в известном журнале Nature, показало, что бактерии, обитающие в раковых клетках, можно использовать для повышения эффективности иммунотерапевтических методов лечения онкологических заболеваний. Результаты исследования могут также пролить свет на то, как кишечные бактерии влияют на успех иммунотерапии.
Авторы исследования: Шелли Калаора, Ади Наглер, Дебора Неджман, Михал Алон, Хая Барболин (Институт Вейцмана, Израиль), Эйлон Барнеа (Израильский технологический институт Технион, Израиль), Стивен ЛК (Нидерландский институт рака, Нидерланды), Гоюань Чэн (Национальный онкологический институт, США), Кевин Вервье (институт Wellcome Sanger, Великобритания), Ноам Шенталь (Открытый университет Израиля), Юваль Бусси, Рон Роткопф, Ронен Леви (Институт Вейцмана, Израиль), Гил Бенедек (медицинский центр Хадасса, Израиль), Софи Трабиш, Тали Дадош, Смадар Левин-Зайдман, Леоре Т. Геллер, Равид Штраусман, Ярдена Сэмюэлс (Институт Веймана, Израиль).
Вступление
Известно, что различные виды бактерий колонизируют опухоли человека[1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9], размножаются в них и модулируют иммунную функцию, что в конечном итоге влияет на выживаемость пациентов с раком и их реакции на лечение[10, 11, 12]. Однако неизвестно, представлены ли антигены, полученные из внутриклеточных бактерий, молекулами человеческих лейкоцитарных антигенов класса I и II (HLA-I и HLA-II, соответственно) опухолевых клеток, или же такие антигены вызывают иммунную реакцию инфильтрирующих опухоль Т-клеток.
Революция в иммунотерапии последнего десятилетия резко увеличила показатели выздоровления от некоторых видов рака, особенно от рака кожи меланомы. Однако около 60% пациентов с меланомой не реагируют на иммунотерапию. Лаборатория профессора Джорданы Самуэльс в отделе молекулярной клеточной биологии исследует молекулярные «предупреждающие знаки» — короткие белковые сегменты (пептиды), которые отображаются на поверхности раковых клеток. Эти пептиды указывают на то, что раковые клетки являются чужеродными для организма и, следовательно, можно повысить способность иммунной системы их обнаруживать, тем самым повышая эффективность иммунотерапевтического лечения.
Мы расширили поиск новых предупреждающих знаков для белковых сегментов бактерий, живущих внутри опухолевых клеток.
Ход исследования
Используя методы исследования, разработанные доктором Равидом Штраусманом, группа исследователей изучила образцы 17 метастазов меланомы, взятых у девяти разных пациентов. Ученые составили карту геномного профиля бактерий, обнаруженных в этих опухолях, и обнаружили все пептиды, которые могла выявиь иммунная система организма.
Некоторые из идентифицированных нами пептидов принадлежат к известным штаммам кишечных бактерий. Эти данные проливают свет на влияние кишечных бактерий на шансы на успех иммунотерапевтического лечения.
Анализ данных выявил на поверхности клеток меланомы почти 300 пептидов от 41 различных штаммов бактерий. Многие из обнаруженных пептидов появлялись в разных метастазах у одного и того же пациента или в образцах от разных пациентов. Будущие исследования позволят определить, могут ли некоторых из идентифицированных пептидов увеличивать иммунный ответ больше, чем другие, что позволит врачам прогнозировать шансы на успех иммунотерапевтического лечения, а также предлагать пациентам с этими пептидами индивидуальные методы терапии.
Непонятно, почему раковые клетки «выбирают»отображение предупреждающих знаков, которые происходят от бактерий, — суицидальное действие, которое может позволить иммунной системе идентифицировать и уничтожить их, но было бы ошибкой не воспользоваться ошибками рака для улучшения иммунотерапии. По этой причине исследователи вырастили Т-клетки пациентов с меланомой в лаборатории с бактериальными пептидами, полученными из опухолевых клеток этих пациентов, и показали, что Т-клетки были нацелены против этих пептидов.
Кроме того, некоторые из идентифицированных пептидов принадлежат к известным штаммам кишечных бактерий. Эти результаты проливают свет на влияние кишечных бактерий на шансы на успех иммунотерапии — связь, которая была обнаружена в предыдущих исследованиях.
Результаты
Результаты исследования показывают, что бактериальные пептиды, отображаемые на опухолевых клетках, могут служить мишенями для иммунотерапии. Их можно использовать, чтобы помочь Т-клеткам более точно обнаруживать опухоль, чтобы они могли действовать более эффективно против рака. Этот подход может быть реализован в будущем в сочетании с существующими иммунотерапевтическими препаратами.
Примечания
-
Two-step enhanced cancer immunotherapy with engineered Salmonella typhimurium secreting heterologous flagellin
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28179508/ -
Solid tumors provide niche-specific conditions that lead to preferential growth of Salmonella
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27145267/ -
Potential role of intratumor bacteria in mediating tumor resistance to the chemotherapeutic drug gemcitabine
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28912244/ -
The Pancreatic Cancer Microbiome Promotes Oncogenesis by Induction of Innate and Adaptive Immune Suppression
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29567829/ -
The human tumor microbiome is composed of tumor type-specific intracellular bacteria
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32467386/ -
Fusobacterium nucleatum infection is prevalent in human colorectal carcinoma
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22009989/ -
High-resolution bacterial 16S rRNA gene profile meta-analysis and biofilm status reveal common colorectal cancer consortia
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29214046/ -
Analysis of Fusobacterium persistence and antibiotic response in colorectal cancer
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29170280/ -
The Microbiome of Aseptically Collected Human Breast Tissue in Benign and Malignant Disease
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27485780/ -
Genomic analysis identifies association of Fusobacterium with colorectal carcinoma
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22009990/ -
Fusobacterium nucleatum potentiates intestinal tumorigenesis and modulates the tumor-immune microenvironment
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23954159/ -
Tumor Microbiome Diversity and Composition Influence Pancreatic Cancer Outcomes
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31398337/
Другие актуальные исследования:
- Израильское исследование показало, как справиться с опасной бактерией
- Астма не усугубляет течение COVID-19 — результаты нового исследования
- Израильские исследователи обнаружили генетический маркер устойчивой к лекарствам множественной миеломы — путь к разработке индивидуальных методов лечения
- 4 сезона гормональной активности: израильские учёные выяснили, как время года влияет на уровни гормонов